| Serogroup: | O139 |
|---|---|
| Serotype H: | 1 |
| Serotype K: | 82 |
| Strain: | |
| Structure: | bDGlc(1->3)
|
->3)aLRha(1->4)aDGalA(1->2)aLRha(1->3)aLRha(1->2)aLRha(1->3)aDGlcNAc(1-> |
| Comment: | - Structure [2] - O.6 O-acetyl groups/repeating unit - Cross-reacts with Yersinia enterocolitica O28 [1] |
| GTs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WfaI | aLRha(1-> |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WfaJ | aDGalA(1-> | ->2)aLRha | 2 | 4 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WfaK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WfaL | aLRha(1-> | ->3)aDGlcNAc | 4 | 1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [3] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMR | ||
|---|---|---|
| 1H-NMR | 5.18 4.27 3.84 3.51 3.66 1.27 5.12 4.34 4.06 3.66 3.89 1.31 5.05 3.89 4.15 4.45 5.08 5.03 3.73 3.86 3.46 4.02 1.25 5.02 4.11 3.80 3.61 4.00 3.82 3.82 4.84 4.15 3.85 3.52 3.78 1.28 4.59 3.25 3.46 3.22 3.39 3.62 3.88 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 30C | |
| pD: | 2.4 | |
| Ref: | TSP 0.00 ppm | |
| Comment: | 1H-NMR [1], pD=2.4, de-O-acetylated | |
| 13C-NMR | 102.30 67.40 75.50 70.80 70.10 17.70 100.40 76.50 79.90 71.90 70.10 17.40 98.00 68.50 70.70 78.60 71.20 173.20 100.40 81.10 70.70 73.00 70.10 17.40 94.80 54.00 80.20 69.00 72.70 61.10 103.20 70.70 79.00 72.40 70.10 17.70 105.50 74.40 76.60 71.00 76.90 62.20 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 30C | |
| pD: | 2.4 | |
| Ref: | Dioxane 67.40 ppm | |
| Comment: | 13C-NMR [1], pD=2.4, de-O-acetylated | |
| Non-Sugar Components |
|---|
| - Acetate |
| Enzymes | ||
|---|---|---|
| Flippase | MPLSKSIYAILSISCLLLGLYIQFLFAEFYQGDFLNLFYLGVSFCSVVISMSSGGLGGFLISRFSNLSET LRLDIAVFSFTIVFSIIGVGVFCALSYTSLFVLKMALHQSLIIAFLFFLYLLSLALNLIFQSYSYSKKGI SGPIFYEFCSLISYILVAFLLVINKEDYIICCILFCVRGYFQLILYYIFCKDKIACRLINGDEVKSFFNE IKYLMSGSAYYKSEPLIDRFFLVASSHNLAAYHLISQIYNAALGLWFKISVSPLVNKLTQNTTNTIVFMK LFRRGLLSQCIISIVSAIILFFTPTLHYLESINIFRPIAQNADVVYLLFIFFVASLLGQVVSNAYYSIGH HKTPVIVSCITYTLFLPAKYYLVKRYGVSGLCILVSLYHTVNFIILWLMFRVKDES | |
| Trembl: | Q2VJ24 | |
| Polymerase | MSFIHILLLIILFYLPFIFLKFGLRKKITHPPTLFCAIFSFVLSMAYIAHITLGFYEISYESYAIYGLGN LSFIAGGMITDALNRRNIKNSTQLVINKQEITLLKILIFTLLLYFPIAYSEFKHATPDMPLALKILRIRE RGLEEQVYSTITNNMIILSSCLVMYMTFIFSIKKINVYYYSLTFVLFCAYNFMTGTRAAIILISIACIFI YLLNTNKNNKTSKLFLLSVGMTAIILGALVAIFMGKDGMERDESLLANLNKVVDNYFSYTVQGVILFDNY VIGREKITPNWDILSGSAEVINKITSSNIFKTDSKFSEFSHFAKDKDGNVCTIYFAIYPLYGLVGVILFF LLYGTVCTILYNHGPGIVSVLVGYINATLCLNIFNEQVFINIIFTIKFICFLLLIRCFERIK | |
| Trembl: | Q2VJ26 | |
| Literature | ||
|---|---|---|
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