| Serogroup: | O6 |
|---|---|
| Serotype H: | 1 |
| Serotype K: | 2 |
| Strain: | DSM 6601 |
| Structure: | ->4)aDGalNAc(1->3)bDMan(1->4)bDMan(1->3)aDGlcNAc(1->
|
bDGlc(1->2) |
| Comment: | - Structure [1] - Strain is given for gene sequence study and is for serotype O6:K5:H1 [2] |
| GTs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orf3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orf4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orf5 | bDMan(1-> | ->4)bDMan | 3 | 2 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orf7 | bDMan(1-> | ->3)aDGlcNAc |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMR | ||
|---|---|---|
| 1H-NMR | 4.80 3.98 3.81 3.84 3.55 3.86 3.74 4.91 4.13 4.01 3.68 4.17 3.84 3.77 5.32 4.30 4.06 4.09 4.29 3.79 3.73 4.81 4.37 3.85 3.84 3.46 3.95 3.80 4.68 3.38 3.49 3.44 3.42 3.87 3.74 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 55C | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 2.225 ppm | |
| Comment: | 1H-NMR [1] | |
| 13C-NMR | 101.60 71.50 72.80 78.10 76.20 62.20 99.40 54.10 81.80 69.50 73.10 61.80 100.30 51.20 68.50 78.60 73.70 61.50 101.80 78.90 77.90 68.00 77.90 62.20 104.70 74.90 76.80 70.80 77.40 61.60 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 70C | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 31.45 ppm | |
| Comment: | 13C-NMR [1] | |
| Enzymes | ||
|---|---|---|
| Flippase | MNRIQRVHNYLRLKDKIKNVFLGLYILQLFNYIAPLVIIPILIKYIGLGEYGELVYITSI YQIVALIIDFGFTYTGPVVAARHRCETQNLQRYYSIVVLLKSLLFIIALTCVFLLCRLNI VHLSFFGFLSIFLCTIGNILSPNWFLQGIGDFKKLSYSQVIVRITLFIILLVYVCSGGDN VFILSFLQNATLLICCIYLWPNIHISHVVHLKPNECIVEFKKAGNVFIGVIGTIGYNGLI PVLIGNLCGNTSLGVFSIVQKMTTACQSLINPISQYMLSQVSEIKPQDKLFYYRIKKSFF VHLTISIIACLCYMGLGQYVATFIGKVDVSFVIILFASIITIFSSLNNVLGIQFLIPTDN VKILRSINVMAGIIVVSLSWLLISRFDILGGVLLNLIGEFLVFSMLAFIAHRKWGARV | |
| Trembl: | Q8KMW2 | |
| Polymerase | MKVKAVPAITFYLSLMLTILVLLFGNEPNKSQYILVIATITVFYIAYITNKITSPASLLV ISSFVFLGCRPLLSLFANYDYRIADWFIEGYMDDDVILANYAITLMYYGYTLGLILCKNT EKFYPHGPYPEKQLLKIKFLLTLFFLGSIGMVVKGIFFFNFIESNSYVDIYQSNITTPIG YDFLSYLFYCSFFLICAFHIQFRTNKKFLFIAICIAAFSTLKGSRSEAITFLLTVTCIYF NEVKTRNLRLLITMIFVFSVIFVISEFISMWRTGGSFFQLMQGNNPVINFVYGMGVSYLS IYQSVKLQLLSGGYNVTYLFSQLIITCSSIFNVKLSLPEISYSHLASYTANPELYNLGFG LGGSYLAESFLAFGLIGCFIIPFLLLLNLNVLEKYTKNKPIIYFVYYSVLPPILFTPRET LFYFFPYLVKSIFVAFLVTLYIQYKKD | |
| Trembl: | Q8KMV4 | |
| Literature | ||
|---|---|---|
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