| Serogroup: | O4 |
|---|---|
| Serotype H: | 5 |
| Serotype K: | 3 6 12 |
| Strain: | |
| Structure: | aDGlc(1->3)
|
->2)aLRha(1->6)aDGlc(1->3)aLFucNAc(1->3)bDGlcNAc(1-> |
| Comment: | - Structure [1] - A slightly different structure is proposed for serotype K12:H- in [4] |
| GTs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbuB | aLFucNAc(1-> | ->3)bDGlcNAc | 1 | 1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbuH | aDGlc(1-> | ->3)aLFucNAc | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbuG | aLRha(1-> | ->6)aDGlc | 3 | 3 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMR | ||
|---|---|---|
| 1H-NMR | 4.97 3.43 3.66 3.37 3.83 3.83 3.65 4.97 4.29 3.86 3.81 4.34 1.15 4.71 3.84 3.51 3.45 3.37 3.88 3.68 4.84 4.16 3.82 3.27 3.65 1.22 5.05 3.63 3.74 3.42 3.95 3.76 2.69 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 90C | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 2.225 ppm | |
| Comment: | 1H-NMR [3] | |
| 13C-NMR | 101.80 72.80 74.20 70.90 72.40 67.80 99.30 49.35 77.90 72.50 68.10 16.60 103.15 56.70 80.40 70.10 77.20 62.20 100.90 75.50 76.00 72.20 70.40 17.90 96.50 72.80 74.60 71.00 72.85 62.00 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 90C | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 31.45 ppm | |
| Comment: | 13C-NMR [3] | |
| Enzymes | ||
|---|---|---|
| Flippase | MSLIRNSFYNIAGFAVPTLVAVPALGILARLLGPENFGLFTLAFALIGYASIFDAGISRA VIREIALYRESEKEQIQIISTASVIVLFLGVVAALLLYFSSNKVVELLNVSSVYIETAVR AFSVISFIIPVYLINQIWLGYLEGLEKFANINVQRMISSTSLAILPVIFCYYNPSLLYAM YGLVVGRVISFLISAIICRDIILKSKLYFNVATCNRLISFGGWITVSNIISPIMAYFDRF IISHIMGASRIAFYTAPSEGVSRLINIPYALARALFPKLAYSNNDDERKKLQLQSYAIIS IVCLPIVVIGVIFASFIMTTWMGPDYALEAATIMKILLAGFFFNSLAQIPYAYLQSIGKS KITAFVHLIELAPYLLLLYYFTMHFGIIGTAIAWSLRTFCDFVILLSISRRK | |
| Trembl: | Q5GFM7 | |
| Polymerase | MIYLLFFFALFMICTFLTHRRQALYVVSALVFLFLALTYPSGGDWIGYFLHYDCMVNEQC NNGFIMFEPGYELIVSLFGYLGFQTIIIFIAAVNVILILNFAKHFENGSFVIVAIMCMFL WSVYVEAIRQALALSIVIFGIHSLFLGRKRKFITLVLFASTFHITALICFLLMTPLFSKK LSKIISYSLLIFSSFFFAFSETILSALLAILPEGSIASEKLSFYLATEQYRPQLSIGSGT ILDIILIFLICVSFKRIKKYMLANYNAANEILLIGCCLYISFGIFIGKMMPVMTRIGWYG FPFVIVLLYINLGYSEYFKRYINKRGCGYSKLLIAFYFLLQILRPLTYDYSYYNIMHQDT LLNRFDALDDASLRQSAKRKCFDLGKIGYGFLCSI | |
| Trembl: | Q46955 | |
| Literature | |||
|---|---|---|---|
|