| Serogroup: | O113 |
|---|---|
| Serotype H: | 21 |
| Serotype K: | 75 |
| Strain: | |
| Structure: | ->4)aDGalNAc(1->4)aDGalA(1->3)aDGal(1->3)bDGlcNAc(1->
|
bDGal(1->3) |
| Comment: | - Structure [1]. Position of acetate not determined |
| GTs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbnA | bDGal(1-> | ->4)aDGal |
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| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbnB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbnD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GT name | Donor | Acceptor | Position | Link.Num | Similar to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WbnE | aDGal(1-> | ->3)bDGlcNAc |
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| ncbi CAZy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - Reference [2] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMR | ||
|---|---|---|
| 1H-NMR | 5.39 3.94 3.94 4.24 3.91 3.74 3.74 5.27 3.95 4.12 4.45 4.88 4.96 4.22 4.03 4.44 4.39 3.79 3.64 4.96 3.86 3.83 3.68 3.44 3.92 3.74 4.46 3.56 3.65 3.95 3.67 3.78 3.78 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 313K | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 2.230 ppm | |
| Comment: | 1H-NMR [1], de-O-acetylated | |
| 13C-NMR | 100.36 67.81 76.51 66.75 71.16 61.29 97.06 68.60 69.06 79.32 71.45 172.49 99.84 49.71 78.15 76.14 70.75 60.65 102.06 55.01 81.16 71.73 75.86 61.68 105.85 71.82 73.77 69.50 75.79 62.06 | |
| Solvent: | D2O | |
| Temp: | 313K | |
| pD: | ||
| Ref: | Acetone 31.07 ppm | |
| Comment: | 13C-NMR [1], de-O-acetylated | |
| Non-Sugar Components |
|---|
| - Acetate |
| Enzymes | ||
|---|---|---|
| Flippase | MEKNSDKLRTGVRWSAIERIITQIAQLGILLILSRILGPKAYGLIGMLTIFIAISQTLVD SGFSSALIRRNKNSQKQYSTIFWFNLIVSLLIYAVIFFMSPHISAFYREKELSDILRVLS LLVIINALSIVHRARLTIMMDFKTQTKISLIAVLGSGVVSVILAKNGWGVWALVVNNLVF ATISTFLYFWFCKWLPDFIFQLKFFKVTAAFSVKLMIASLLNTFFDNIYQLVIGKVFYPT QVGYFTQAKNLTLLPANTYSAIIQRVTYRYFSEIKNDRVRLRQKYEEVMRISAFIFFPLT ISFSIFSNNIIVFLIGKAWEEAAKYISILSWCYVLYPIHAISLNILNVFGRSDLFLKVEI IKKIIITVCLITTYKYGISAICMGMVFYSLLATYINTIHTNRIIKTNFIALIRIISPIAF ISMLSATISFVICKFFDNNIIYIFGIMISLIIYYLIYYFVDRKIVLTIWKVNK | |
| Trembl: | Q9RP63 | |
| Polymerase | MNTTSVICFIVFLLNPSFGCFLFLLTLFNHEKLSIFFISLFAGILAYNLVPYDTMDLASH YMKFSELHNMSVSDIWSDGVNIFLYLCMKCLNAAGINKEWLPFIATFIGYYILLNALRNN IPAYWCRKEKMICFIIWLLSISFLSLSNGIRSGLSSAFFIYAVICQRNYRHLSFIIYSVL ACMMHSFAIPMVILLFSMPLILKRKMLSQRFFKIAIIMSVSLSFLVDINSLIVFIFNNLS FLPYIDQIYNIYIIGDRWGGGASFDTNTFIARLITQAPFFYCILVLLISKRKDDFFILGA ILVSVSLFLSQFWVVSERYQYVSVLLVTLHLIFNNEYFLLRRKIIILLYFVIQTAVLIWG LYRFRYMILPSLEFIIYPFLFCFYNTVDMNKLIKV | |
| Trembl: | Q9RP61 | |
| Literature | |
|---|---|
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